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故事 / 22 分钟

从寒武纪颚到昆虫基因组的十三个证据档案

沿具名化石、转录组矩阵、时钟模型与基因敲除前进,同时不把泛甲壳动物、陆地化或飞行改写成单一祖先阶梯。

每一步标明所依据的主张,引用列于下方。交互探索状态可在完整应用中打开;故事本身仍是编辑综合。

故事步骤

01 · 508 Ma · 证据

一具布尔吉斯页岩躯体展示早期颚

正模 ROM 63823 与副模 ROM 63824 保存已发表矩阵所评分的附肢组合。

有颚肢类干群位置是矩阵结果;托昆米亚既不是被证明的直接祖先,也不是甲壳类、昆虫或多足类冠群。

claim:event:tokummia-mandibulate-anatomy
02 · 508 Ma · 证据

标本系列取代单一理想化瓦普塔虾

ROMIP 56432 图示颚与小颚,ROMIP 64294 则在更大标本系列中展示离散但相对的颚。

泛甲壳动物位置与主动游泳捕食是拓扑和功能解释,不是胃内容物、被观察到的行为或直接祖先主张。

claim:event:waptia-mandibulate-series
03 · 518 Ma · 证据

微小磷酸盐化躯体保存生长阶段

拓模系列保存多个发育阶段,包括依据磷酸盐化软部解剖复原的八胸节阶段。

真甲壳类冠群位置与上肢同源取决于性状解释,不得转化为精确冠群起源日期。

claim:event:yicaris-developmental-series
04 · 0 Ma · 树

九个转录组检验取样不足的分支

九个新 454 转录组与形态、化石、EST、基因组、线粒体蛋白及核糖体数据联合。

介形虫单系性和多个深层节点随快速基因、远缘外群或数据分区改变;任何显示分支都不是化石观察。

claim:event:ostracod-phylotranscriptome-topology
05 · 0 Ma · 树

扩展洞虾类取样检验六足类姐妹群

扩展洞虾类取样在多种方法中反复恢复洞虾类加六足类,并支持若干泛甲壳动物大类群。

桡足类、头虾类等深层位置仍对方法和取样敏感,因此该树是受检验假说,而非固定祖先阶梯。

claim:event:pancrustacea-remipede-phylogenomics
06 · 0 Ma · 树

增加七个类群即可重组深层分支

最终 105 类群矩阵包含 90 个转录组、15 个基因组与 576 个蛋白编码基因,并与同一流程构建的 98 类群替代矩阵比较。

被拒绝和恢复的类群在取样矩阵与模型间不同;分化估计使用十三个审查校准点,但仍是时钟输出。

claim:event:pancrustacea-taxon-sampling-sensitivity
07 · 409 Ma · 证据

泥盆纪腹部保存弹尾类式弹器

四件头壳与约十件后来发现的躯体标本包括首个报道的完整腹部和可与现生弹尾类比较的弹器。

该采样出现支持弹尾类亲缘,但本身不能给六足类陆地化、全球起源或生态优势定年。

claim:event:rhyniella-springtail-material
08 · 409 Ma · 证据

一块头部碎片支持不相容身份

NHMUK PI IN 38234 保存一块孤立头部碎片,其颚在 2004 年被解释为双髁并可能类似翼昆虫。

2017 年三维重析认为这些结构更符合多足类、可能为蚰蜒形蜈蚣;因此昆虫与飞行校准存在争议。

claim:event:rhyniognatha-contested-affinity
09 · 0 Ma · 地图

基因与化石比较登陆路线

核心数据集包含 57 个类群与 246 个基因,并以化石校准和 30 物种泛节肢动物子集进行拓扑检验。

受支持的海洋路线与推断年代是受拓扑、校准和祖先状态编码制约的模型输出,不是被观察到的迁徙。

claim:event:arthropod-terrestrialization-clock
10 · 324 Ma · 证据

压扁翅锚定一项石炭纪出现

约 10 毫米长的压扁前翅碎片在最下部纳穆尔阶保存横脉以及 ScP、R 等主脉分支。

古直翅类亲缘依据不完整翅脉,一件碎片不能给动力飞行的获得或翼昆虫全球首现定年。

claim:event:paskov-carboniferous-wing
11 · 0 Ma · 证据

基因敲除检验翅同源模型

CRISPR 扰动与表达域比较海滨跳钩虾近端足节与蟋蟀等昆虫的体壁和翅结构。

发育对应支持同源模型,但不保存第一片翅、其生态或一个唯一识别的化石前体。

claim:event:parhyale-wing-homology-knockout
12 · 0 Ma · 树

1,478 基因矩阵为采样昆虫分支定时

研究采样 144 个物种、1,478 个蛋白编码基因,并在 BioProject PRJNA183205 归档转录组。

拓扑与节点年代依赖取样、直系同源、序列模型、化石归属和时钟先验;它们不是被观察到的化石首现。

claim:event:insect-1kite-topology-clock
13 · 307 Ma · 证据

五件小型化石扩展石炭纪样本

所述样本包括甲虫干群、全变态幼虫、膜翅类干群、早期半翅类和早期啮虫类。

这些标本不证明同步起源、冠群目的精确首现或后来多样化的单一气候原因。COL26.8 经 crustaceans-insects 路由 1,049,133 个现生接受种名;这是命名覆盖,不是 1,049,133 个证据档案或系统基因组共识。

claim:event:pennsylvanian-eumetabola-sample

参考文献

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